L’enjeu 1 du LMI s’articule autour de 3 grands axes de recherche permettant d’étudier le fonctionnement des récifs coralliens et écosystèmes associés sous sa diversité, sa structure et la dynamique des communautés.
- Analyse multi-échelles de la diversité spécifique, phylogénétique et fonctionnelle :
Au travers d’approches intégrées, et pour certaines novatrices à Madagascar (comme le barcoding, l’ADNenvironnemental, les observations sous-marines en plongée ou par vidéo, les pièges lumineux, ou encore le dosage d’isotopes et de nutriments), l’objectif est de caractériser la diversité et la connectivité fonctionnelle (poissons et invertébrés notamment) des récifs coralliens et écosystèmes associés (écosystèmes coralliens mésophotiques, mangroves, herbiers). Cet axe intègre également, à partir de données collectées dans différentes régions du pays, l’étude des relations biogéographiques et phylogéographiques de la diversité marine malgache et de son endémisme (poisson en particulier).
- Trajectoires spatio-temporelles des populations et des communautés d’organismes marins côtiers :
Sur la base des recherches menées en phase 1 du LMI, cet axe vise à poursuivre et étendre les réseaux de suivi de l’état de santé des communautés récifales, incluant les coraux, invertébrés, algues et poissons. Des suivis de populations de mégafaune marine à fort enjeu de conservation (requins, raies, tortues marines, oiseaux marins) viennent compléter les suivis des communautés. S’agissant des oiseaux marins, il existe un jeu de données conséquent (acquis depuis les années 2000) qui permet d’aborder les questions de dynamique des populations et de comportement migratoire. Ces différents suivis doivent permettre de développer des bioindicateurs de l’état de santé des écosystèmes côtiers tout en facilitant les restitutions auprès des décideurs politiques et acteurs de la société civile.
- Etude sur la démographie, les mécanismes de régulation et les capacités de résilience des communautés :
Ces recherches doivent permettre de mieux comprendre les stratégies reproductives, les processus de recrutement et les mécanismes de régulation des populations (exemple : caractériser les performances écologiques des communautés et leur capacité à résister ou à se rétablir après une perturbation locale ou régionale, telle qu’un évènement de blanchissement corallien). Concernant les coraux, un suivi interannuel de l’abondance, la diversité et du recrutement est mis en place depuis la phase 1 dans la région de Toliara. A cela s’ajoute par exemple des données de pression d’herbivorie exercée par les poissons et invertébrés.