Les objectifs de la composante « poissons » seront de poursuivre l’amélioration des connaissances sur la diversité ichtyologique à Madagascar et de mettre en place des outils pérennes de suivi de cette diversité.
Les actions de cette composante porteront uniquement sur les poissons à nageoires rayonnées (Actynoptérygiens).
La mise à jour des listes d’espèces présentes à Madagascar initiée dans le cadre des travaux de la JEAI « ACOM » sera amplifiée avec pour ambition d’améliorer la taxonomie et la systématique de certains groupes.
La description de la biodiversité des poissons marins s’effectuera ainsi non seulement à l’aide des caractères morpho-anatomiques à la base de la taxonomie actuelle mais également des caractères génétiques du barcode ADN sélectionnés par BOLD, base qui est maintenant une référence pour l’identification des organismes vivants et en particulier des poissons.
L’analyse taxonomique portera sur les juvéniles et adultes de poissons débarqués par les pêcheurs de la zone côtière, en étroite collaboration avec la composante « pêche ».
Grâce aux séquences COI et 12S obtenues, l’approche consistant à assigner des traces d’ADN présentes dans l’eau (ADN environnemental) sera expérimentée dans quelques sites pilotes afin d’évaluer sa pertinence pour le suivi de la biodiversité marine à Madagascar.
Les analyses de barcoding et de metabarcoding seront réalisées sur la plateforme CEMEB de l’Université de Montpellier.
